明朝之前，为了消除后顾之忧，并积蓄力量，达到“征服过来，为我效力”的目的，对已归服大清国的索伦部，借口博木博果尔“既而叛去”为由，兴师动众，诉诸武力，从1639年（明崇祯十二年、清崇德四年）底开始遭兵征讨索伦部，连续发动3次战役，时间长达三年零七个月。
皇太极自1639年12月2日起，遣清军16000人至呼玛河口，兵分两路，分进合击索伦部，自额尔古纳河口至精奇里江之间黑龙江沿岸摆开战场，以博木博果尔所属的铎陈、阿萨金、雅克萨、多金四木城为主要攻击目标，打响了第一次战役。“四木城”人为保卫生命和财产，不畏前来掠夺的清军，在博木博果尔的指挥下，纷纷拿起狩猎用的弓箭、扎枪及木棍、石块等为武器抗击清军，给清军以迎头痛击，使左翼军受阻，右翼军副将叶克书前来助战，火攻木城，焚烧城屯，乘火势占领了雅克萨城。然后，萨穆什喀率左翼军深入，令八旗各章京各率‘20人前进，至兀库尔城。时有达尔布尼、阿哈都护、白库都、汉必尔代4人，集中7个屯之人在兀库尔城抗击清军，坚守一整天，至晚清军“举火”焚城之后才失守，博尔博果尔的胞弟噶凌阿及妻子220人被俘，关押于兀库尔城。在这紧急关头，博木博果尔一声令下，各城屯民众一呼百应，群起而攻之，有索伦、达斡尔（除巴尔达齐居住的多科屯外）、鄂伦春民众6000人来战。此时，清军主将“闻各路报，博木博果尔 索伦之兵来战……兵共六千来袭”，立即集中兵力，准备反击。博木博果尔亲自率领乌鲁苏城的索伦兵，指挥各路队伍袭击了集结在铎陈城一带的清军主力，重创清军，打死打伤l300多人，使清左翼军损失惨重。后来正白、正红、镶黄三旗清军相继投入战斗，博木博果尔被围困在激战中率200多人突围，博木博果尔终于因寡不抵众而失败。清军占领城屯16处，在战斗中索伦部民众亡400人，被俘7604人，清军夺牛马l128头匹，收毛皮5400张。并把俘获的7604人。按照皇太极“令其从军役使”的旨意，发落到沈阳、锦州等地为军役和奴隶，均改称为 “新满洲”达到了掳掠有生力量补充兵员的目的。博木博果尔战败后，带领一部分索伦民众跋山涉水转移到贝加尔湖以东的赤塔河流域休养生息。皇太极得知后，1640年9月12日遣甲喇章京席特库和济哈赴哈藩（漠北）蒙古，率其官属兵丁350人第二次征讨博木博果尔。席特库奉命率外藩蒙古兵往追，路经喀尔喀蒙古车臣汗部，经两个半月至甘地（堪斯克），俘获博木博果尔之弟
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